期刊部下设有《中国医院统计》《滨州医学院学报》两个编辑部和综合部3个部门。
一、《中国医院统计》
《中国医院统计》是由国家卫生健康委员会主管，国家卫生健康委统计信息中心、滨州医学院主办的国家级专业学术期刊。1994年3月经国家科委、国家新闻出版署批准创刊，国内外公开发行，国内刊号CN 37-1254/C，国际刊号ISSN 1006-5253。本刊以“加强医院统计信息工作，提高医院科学管理水平”为办刊宗旨，坚持“百花齐放，百家争鸣”的办刊方针。以全国各级医院从事统计、临床、病案、信息、医院管理的广大工作者及高等院校相关专业师生、科研人员为读者对象，主要刊登医院统计学及相关领域的科研成果和进展。设有专家论坛、述评、医疗数据统计、住院统计、门诊统计、病案统计、疾病分类、医院管理、卫生调查、基础理论与方法、统计软件应用、综述、专题研究等栏目。本刊创刊时为季刊64页，2004年增至96页，2012年改为80页双月刊。截止2022年10月底该刊共出版29卷、136期，现每期印刷量1500册。
二、《滨州医学院学报》
《滨州医学院学报》是经国家科技部、国家新闻出版总署批准，由山东省教育厅主管、滨州医学院主办，面向国内外公开发行的综合性医学学术期刊。本刊主要刊载基础医学、临床医学、预防医学、口腔医学、药学、护理学、中医学、中西医结合、医学教育与改革及其他医学相关领域的新理论、新成果、新技术、新方法和新经验。其宗旨是以马列主义、毛泽东思想、邓小平理论、“三个代表”重要思想、科学发展观及习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，贯彻“双百”方针，发扬学术民主，尊重科学，实事求是，及时报道医学科学研究成果、先进的医疗方法和技术，加强国内外医学学术交流，推动我国医学教育、科研和医疗技术进步。主要栏目有论著、综述、经验交流、个案报道、述评与讲座、技术方法、医学教育与改革等。本刊创刊于1978年3月，双月刊，每年6期。国内刊号CN 37-1184/R，国际刊号ISSN 1001-9510。2002年为提高学术质量该刊页码由106页改为80页。截止2022年10月底该刊共出版45卷、217期，每期印刷量1000册。
